Beba oteta pri rođenju i podignuta od strane žene koja ju je otela, na kraju otkriva da je nestalo dijete, ponovno se povezuje sa svojim biološkim roditeljima i bori se s izborom između svoja dva identiteta.
Nakon međusobne borbe u prvom filmu, mutantski neprijatelji profesor Xavier i Magneto moraju se udružiti da nađu mutanta ubojicu koji je pokušao smaknuti predsjednika dok Mutantsku akademiju napadaju oružane snage.