"Tišina" prati Rodriguesa i Garupea, dvojicu svećenika koji odlaze u Japan kako bi pronašli voljenog mentora koji se navodno odrekao Boga i kršćanstva. Iako se u Japanu odvija progon kršćana oni ne žele odustati od misije jer su uvjereni da je njihova vjera jača od ičega.